Synamatix gibt Bereitstellung von Bioinformatik-Lösungen für Sequenzierer der zweiten Generation bekannt
Kuala Lumpur, Malaysia (ots/PRNewswire)
Synamatix gab heute die Herausgabe zweier neuer Softwareanwendungen bekannt, die speziell auf die Verarbeitung und Auswertung der Daten grossangelegter, mit DNA-Sequenzier-Plattformen der zweiten Generation durchgeführter Re-Sequenzierungsprojekte ausgerichtet sind.
Robert Hercus, Generaldirektor von Synamatix, kommentierte: "SXOligosearch(TM) und eine modifizierte Version von SynaSearch(TM) wurden herausgebracht, um die explodierenden Datenfluten zu beherrschen, die durch den zunehmenden Einsatz der DNA-Sequenzier-Plattformen von 454-Roche und Solexa-Illumina entsteht. Die Anwendungen wurden im Rahmen unserer Strategie entwickelt, eine Reihe von Hochdurchsatz-Anwendungen für die Verarbeitung, Auswertung und Integration von Daten für alle Arten von DNA-Sequenzierern der zweiten Generation bereitzustellen."
Die erste Anwendung, SXOligosearch, wurde dazu entwickelt kurze Abbildungen, wie Auslesungen vom Genomsequenzierer von Solexa-Illumina oder von Oligonukleotid-Mikroarrays Proben zu erfassen. SXOligosearch bietet ein hohes Mass an Flexibilität, da die Software in der Lage ist, eine ganze Reihe von Auslesefehlern bzw. Mutationen zu handhaben. Darüber hinaus bietet sie, verglichen mit herkömmlichen Tools, eine über 100-fach höhere Leistung. Im Gegensatz zu anderen Standard-Alignment-Tools der Branche erstellt SXOligosearch Alignments komplette Auslesungen und nicht nur von HSPs, was zu einer höheren Spezifizität und Sensitivität führt. Die Software kann auch Auslesungen niedriger Qualität mit zahlreichen Falschzuordnungen, Einsetzungen oder Löschungen mit hoher Genauigkeit und überlegener Leistung handhaben.
Darüber hinaus wurde auch eine neue, modifizierte Version von SynaSearch herausgebracht, die Auslesungen der GS20- und FLX-Plattformen von 454 verarbeiten und abbilden kann. Die behutsam durchgeführte Optimierung hat im Vergleich zu Standardansätzen zu einer höheren Genauigkeit, Spezifizität und einer 200-fachen Leistungsverbesserung geführt.
Wenn SynaBASE(TM) als gemeinsame Plattform zum Einsatz kommt, können verschiedene Auslesearten gemischt werden, sodass die Erfassung vergrössert und die zwischen Datensätzen identifizierten Unterschiede besser unterstützt werden.
Zu Synamatrixs anderen Hochleistungsanwendungen, die auf SynaBASE - ihrer einzigartigen, strukturierten Netzwerk-Datenbankplattform - beruhen, gehören SynaTree(TM), SXPRESearch(TM) und SXProbeDB(TM).
Informationen zu Synamatix
Die allen Synamatix Softwareanwendungen zugrunde liegende Technologie ist die firmeneigenen "SynaBASE"-Plattform. Die mithilfe dieser Datenbank-Plattform erstellten Anwendungen zeichnen sich durch bedeutend bessere Skalierbarkeit, Sensitivität und Leistungsfähigkeit aus. Synamatix ist ein in privater Hand befindliches Bioinformatik-Unternehmen der nächsten Generation, das sein Schwergewicht darauf legt, seine Kerntechnologie kontinuierlich weiter zu erforschen und zu entwickeln, neue Softwareanwendungen bereitzustellen und den Kundenstamm in den USA, Europa, Asien und Australien zu unterstützen.
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Patricia Chan
Marketing und Communications
Synamatix Sdn. Bhd.
Tel.: +60-3-2283-1820
E-Mail: enquiries@synamatix.com
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